Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LPIN3Q9BQK8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms