Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AGPAT5P1-201ENST00000455855 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
STRIP1Q5VSL9 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
STRIP1Q5VSL9 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms