Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTXN3Q4LDR2 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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