Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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RTL8BQ17RB0 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
RTL8BQ17RB0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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