Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPRNQ16849 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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PTPRNQ16849 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRNQ16849 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PTPRNQ16849 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PTPRNQ16849 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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