Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NCOA1Q15788 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NCOA1Q15788 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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NCOA1Q15788 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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NCOA1Q15788 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NCOA1Q15788 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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