Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB39AQ14964 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms