Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HSPB3Q12988 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
HSPB3Q12988 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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