Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BEX3Q00994 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms