Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVK-24P63145 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVK-24P63145 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms