Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
RPS29P62273 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
RPS29P62273 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms