Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LOXL3P58215 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms