Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
BRCC3P46736 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms