Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAEP38570 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAEP38570 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms