Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MYL4P12829 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYL4P12829 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MYL4P12829 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MYL4P12829 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MYL4P12829 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms