Protein–RNA interactions for Protein: P07357

C8A, Complement component C8 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8AP07357 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C8AP07357 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C8AP07357 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8AP07357 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8AP07357 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C8AP07357 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C8AP07357 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms