Protein–RNA interactions for Protein: Q96LR4

FAM19A4, Protein FAM19A4, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM19A4Q96LR4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAM19A4Q96LR4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms