Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LMO3-224ENST00000540848 1574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 Metazoa_SRP.26-201ENST00000547793 284 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL137796.1-201ENST00000608190 577 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 RPL26L1-201ENST00000265100 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KCTD12Q96CX2 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms