Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
TRAPPC6BQ86SZ2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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TRAPPC6BQ86SZ2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
TRAPPC6BQ86SZ2 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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