Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CDH11-212ENST00000566827 2395 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LINC00668-204ENST00000580197 2343 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FAM213A-201ENST00000372181 2058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SMAD1-215ENST00000515385 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AL096817.1-201ENST00000623904 1775 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LRG1-201ENST00000306390 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
C16orf54Q6UWD8 PPARD-205ENST00000448077 3516 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms