Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.02■□□□□ -0
BRMS1LQ5PSV4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
BRMS1LQ5PSV4 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms