Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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ALFQ53S48 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ALFQ53S48 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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