Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ZNF426-204ENST00000593003 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP31-201ENST00000264245 9317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PHF8-201ENST00000322659 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BEAN1-207ENST00000564819 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG5-203ENST00000377728 3613 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TXLNG-202ENST00000398155 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 DPP8-204ENST00000358939 2822 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SEC23B-201ENST00000262544 3176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC048338.1-201ENST00000535844 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC048382.5-201ENST00000618330 3667 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 RGS6-201ENST00000343854 5342 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HSPH1-204ENST00000445273 4987 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NAB1-203ENST00000409641 2472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LGR6-203ENST00000367278 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P8-201ENST00000558211 949 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SLC25A35-203ENST00000579192 2136 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NVL-201ENST00000281701 3123 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SYNJ2-204ENST00000367122 3029 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 INSRR-201ENST00000368195 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 VIT-208ENST00000497382 2650 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 AL645937.6-201ENST00000641122 3727 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TRERF1-202ENST00000354325 4138 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 TRAF3IP3-203ENST00000367025 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NBPF6-201ENST00000370040 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
ANKRD39Q53RE8 NBPF4-202ENST00000613157 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms