Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HSD17B12Q53GQ0 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G4F-202ENST00000397272 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ACTR2-202ENST00000377982 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
HSD17B12Q53GQ0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms