Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 SMAD7-208ENST00000591805 1152 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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DDB1Q16531 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
DDB1Q16531 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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