Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 COPS7B-223ENST00000611614 2468 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SSX1Q16384 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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SSX1Q16384 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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SSX1Q16384 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SSX1Q16384 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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