Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
FMODQ06828 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
FMODQ06828 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms