Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EPHB1P54762 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EPHB1P54762 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EPHB1P54762 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EPHB1P54762 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms