Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA2D1P54289 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms