Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 HLCS-201ENST00000336648 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TSPOP30536 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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