Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GJA1P17302 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GJA1P17302 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GJA1P17302 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms