Protein–RNA interactions for Protein: O60271

SPAG9, C-Jun-amino-terminal kinase-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG9O60271 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAG9O60271 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPAG9O60271 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPAG9O60271 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPAG9O60271 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPAG9O60271 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 NAV1-210ENST00000593583 726 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPAG9O60271 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms