Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SLC8A2Q9UPR5 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SLC8A2Q9UPR5 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms