Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KCNK4Q9NYG8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms