Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
POLDIP3Q9BY77 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
POLDIP3Q9BY77 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms