Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PAAF1Q9BRP4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms