Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CSRNP1Q96S65 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CSRNP1Q96S65 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms