Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PCNX1Q96RV3 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PCNX1Q96RV3 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
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