Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 ATG13-207ENST00000526508 4199 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 DDX3X-203ENST00000457138 5346 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PPP1R26P3-201ENST00000612861 3800 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 MRS2-203ENST00000378386 3313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 EFHB-201ENST00000295824 2823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 MINDY1-203ENST00000361936 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 APOL1-206ENST00000426053 2808 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PAPSS1-201ENST00000265174 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 HTR5A-AS1-201ENST00000395731 2703 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SUSD4-207ENST00000484758 2736 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 UBAP2-205ENST00000379239 2513 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 RPS15A-201ENST00000322989 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PDCD11-201ENST00000369797 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ICA1-204ENST00000396675 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 STX16-204ENST00000359617 4273 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 MYO18B-205ENST00000536101 8051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ZNF300-201ENST00000274599 3268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 MUC13-205ENST00000616727 2879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AP001107.1-201ENST00000501708 2792 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 BAGE2-203ENST00000496773 2598 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 COASY-201ENST00000393818 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SMAD9-202ENST00000379826 5592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ZMIZ2-205ENST00000433667 3800 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ICK-202ENST00000356971 6227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 MARCH6-208ENST00000510792 1963 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PMEL-215ENST00000550464 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 TYK2-201ENST00000264818 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AL109618.1-201ENST00000434910 1683 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SERF1A-209ENST00000513436 1693 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ALDOA-213ENST00000564595 1663 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SVIL-203ENST00000375400 6729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PCDHGA8-201ENST00000398604 4605 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AL031733.2-201ENST00000451992 2523 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 LINC01209-201ENST00000451289 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 CLP1-205ENST00000533682 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 LINC01600-201ENST00000624527 2434 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 CMTR2-202ENST00000434935 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 NARS-201ENST00000256854 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 GPRASP2-205ENST00000543253 3935 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AP005058.1-201ENST00000580193 2975 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AL136982.1-201ENST00000444431 4560 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PIK3C2B-202ENST00000367187 7686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PREX2-201ENST00000288368 10750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 DDX6-202ENST00000526070 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AC068299.1-201ENST00000624716 1749 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PEX5L-213ENST00000476138 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 CSNK1A1-201ENST00000261798 6067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 CMIP-211ENST00000621537 4000 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 C1RL-AS1-201ENST00000382215 2086 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ADAMTSL3-201ENST00000286744 7336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 ZNF169-202ENST00000395395 1986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 AL590822.2-201ENST00000606533 4196 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 CYP11B1-204ENST00000517471 1874 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PRAC1Q96KF2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms