Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC007656.1-201ENST00000552238 573 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EDAQ92838 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EDAQ92838 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms