Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTTNBP2Q8WZ74 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC103563.1-201ENST00000429316 123 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 CD300LF-206ENST00000464910 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2Q8WZ74 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms