Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBC4

UBA3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, humanhuman

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA3Q8TBC4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UBA3Q8TBC4 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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