Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TP73-211ENST00000604074 4806 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TDRD12Q587J7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TDRD12Q587J7 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms