Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP39Q53GS9 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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USP39Q53GS9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
USP39Q53GS9 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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