Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SBK1Q52WX2 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms