Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HADHQ16836 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HADHQ16836 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
HADHQ16836 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HADHQ16836 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HADHQ16836 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HADHQ16836 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HADHQ16836 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HADHQ16836 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms