Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CAD-201ENST00000264705 7265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZCCHC14-201ENST00000268616 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FN1-201ENST00000323926 8708 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NUP58-206ENST00000463407 6360 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RAP1GAP2-201ENST00000254695 6661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SLC6A19-201ENST00000304460 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 SPECC1-206ENST00000395530 8133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
ZNF56Q15929 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms