Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
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PCM1Q15154 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PCM1Q15154 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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