Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 LINC02015-202ENST00000436078 2957 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 FAM76A-204ENST00000373954 3567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 PAX8-202ENST00000263335 3735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NBR1Q14596 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 KCNMA1-210ENST00000404771 4014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 BUB1B-PAK6-201ENST00000441369 2767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TBC1D22B-201ENST00000373491 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MYCBP-201ENST00000397572 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TNK1-201ENST00000570896 3122 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NBR1Q14596 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms