Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
SRSF5Q13243 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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